一、结构不同：
正构十二烷烃是直链烷烃，异构十二烷是含有支链的异构烷烃
二、异构十二烷比正构十二烷浊点低。所谓浊点就是油品在试验条件下，开始出现烃类的微晶粒或水雾而使油品呈现浑浊时的高温度。浊点高直接影响产品在低温下的品相。
三、异构十二烷比正构十二烷熔沸点低。在烷烃的同分异构中，主链短的支链就多，而支链多的话，两个分子就容易靠得*近，分子间作用力就小，熔沸点就低，同馏分段挥发比正构烷烃快。
四、异构十二烷比正构十二烷凝点低。可作为低温环境下各种仪器的润滑剂。
五、异构十二烷比正构十二烷毒性低。比如低分子量正构烷烃，近十年中，中国在工业粘胶配制、制鞋、制球、印刷、家具制造和电子产品制造等领域中，大量应用正己烷，导致的正己烷中毒安全事故不断发生。欧盟早已在清洗行业禁止使用正己烷；在美国，大的一次正己烷清洁剂行业整顿发生在2002年至2004年，由美国职业安全与健康管理局（OSHA）以及下属的加利福尼亚职业健康部（OHB）发起。相对于正构烷烃的毒性，支链化烷烃在生毒理方面有显着优势，已经广泛应用在皮肤直接接触的个人护理品配方，日常生活中的家居护理品、与食品直接接触的金属器皿成型加工等。
六、异构十二烷比正构十二烷安定性好。正构烷烃的热氧化安定性差，在高温下易生产过氧化物。
七、异构十二烷比正构十二烷溶解性好。KB值也称贝壳松脂丁醇值，是表示烃类溶剂相对溶解能力的指标，衡量石油溶剂溶解涂料中树脂的能力。KB值越大说明溶剂溶解树脂的能力越强。异构烷烃类KB值23-30，正构烷烃类KB值20-23。
八、异构十二烷比正构十二烷安全环保。表面张力低，内聚力强，易于回收并重复利用。
九、异构十二烷比正构十二烷延展性好。其多支链结构导致分子间作用力小，延展性比正构烷烃好。
十、正构十二烷馏程比异构十二烷馏程窄，在萃取方面正构十二烷*适合
十一、应用行业不同：
异构十二烷用途：

• 气雾剂 • 装饰涂料 • 放电加工（EDM） • 金属加工及防锈油 • 个人护理产品

• 工业清洗 • 印刷油墨液 • **衣物干洗油 • 农作物保护 • 亮光剂和蜡

• 资源提取和水处理 • 化学反应载剂 • 密封剂 • 沿岸油田勘探仪管道浮液 • 无味家居暖炉燃油

正十二烷的用途：用作有机合成中间体;溶剂和色谱分析的标准物质。